Una solución es hacer que una tecla que no usamos sea la que corresponde a este símbolo en có decimal, este símbolo corresponde al 94). Por ejemplo:
Hacerse un script:
#!/bin/bash
xmodmap -e "keycode 95 = 94"
matlab
Nota: despues de ejecutar el comando, la tecla que se ha elegido seguirá correspondiendo al símbolo ^ (por eso la necesidad de que sea una tecla que uno no usa).
Para saber qué el número de la tecla puedes usar xev
